Ezequiel Barco ha sido convocado a la Selección Sub-23 de Argentina por director técnico Fernando Batista para dos partidos contra Dinamarca el 8 de junio y Arabia Saudita el 11 de junio. Los dos partidos se jugarán en Marbella, España como preparación para el grupo Sub-23 a cara de los Juegos OlÃmpicos de Tokio.
Barco ha jugado 14 partidos con la Selección Sub-20 y marcó dos goles con dos asistencias en cuatro partidos en el Mundial Sub-20 de 2019. Barco jugó su primer partido con la Selección Sub-23 en una Victoria 1-0 contra la Selección Sub-23 de Brasil el 17 de noviembre, 2019.
